MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii D1279779 plasmid pD1279779

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020525	ATG	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020525	TAAA	2	8	1689	1696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020525	AATA	2	8	1714	1721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020525	A	8	8	1744	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020525	TAT	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020525	TAA	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020525	TAA	2	6	1875	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020525	GTAAA	2	10	1908	1917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020525	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020525	AAT	2	6	1934	1939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020525	AT	4	8	1980	1987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020525	TAA	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020525	TCT	2	6	2358	2363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020525	TAAA	2	8	2373	2380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020525	ACC	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020525	T	8	8	2448	2455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020525	CTT	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020525	AAT	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020525	T	6	6	2534	2539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020525	ATT	2	6	2589	2594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020525	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020525	TATC	2	8	2636	2643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020525	GATC	2	8	2662	2669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020525	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020525	ATA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020525	TCAG	2	8	2712	2719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020525	CCTA	2	8	2745	2752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020525	T	6	6	2791	2796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020525	AT	3	6	2830	2835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020525	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020525	AGA	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020525	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020525	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020525	TTTAA	2	10	3824	3833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020525	T	6	6	4430	4435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020525	TAA	2	6	4443	4448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020525	ATTT	2	8	5008	5015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020525	T	6	6	5038	5043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020525	GTA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020525	ATT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020525	A	7	7	5136	5142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020525	TAG	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020525	ATA	2	6	5975	5980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020525	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020525	GAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020525	AAG	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020525	ATTT	2	8	6217	6224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020525	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020525	ATT	2	6	6274	6279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020525	ATT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020525	T	6	6	6303	6308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020525	TTCA	2	8	6315	6322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020525	TATT	2	8	6339	6346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020525	ACA	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020525	AAT	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020525	A	6	6	6400	6405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020525	TCA	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020525	T	7	7	6459	6465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020525	AT	3	6	6498	6503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020525	GTT	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020525	A	6	6	6557	6562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020525	T	8	8	6568	6575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020525	T	6	6	6597	6602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020525	AAC	2	6	6610	6615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020525	T	7	7	6638	6644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020525	A	7	7	6664	6670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020525	ATC	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020525	GTG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020525	TG	3	6	6726	6731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020525	A	7	7	6734	6740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020525	A	6	6	6814	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020525	TATT	2	8	6821	6828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020525	TTCA	2	8	6865	6872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020525	A	6	6	6957	6962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020525	A	6	6	6997	7002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020525	AG	3	6	7009	7014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020525	CT	3	6	7095	7100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020525	T	7	7	7109	7115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020525	A	7	7	7182	7188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020525	AGCGA	2	10	7196	7205	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020525	TTGCTT	2	12	7214	7225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020525	A	6	6	7253	7258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020525	CGA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020525	AGCGAA	2	12	7275	7286	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020525	AGCGA	2	10	7302	7311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020525	TTTA	2	8	7391	7398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.